Identifikacija i tipizacija bakterija Listeria monocytogenes u stvarnom vremenu – REALTIME-Listeria

Listeria monocytogenes najpatogeniji je uzročnik zoonoze listerioze. Listerije su ubikvitarne bakterije, preživljavaju i razmnožavaju se unutar velikog raspona pH i temperature te su otporne na visoke koncentracije soli. Najčešće se prenose kontaminiranom hranom. Predstavljaju veliku opasnost za sigurnost hrane i ljudsko zdravlje. Na razini EU listerioza je jedna od najsmrtonosnijih zoonoza pa se njena rana, brza i sigurna dijagnostika smatra jednim od prioriteta kako u svijetu, EU tako i na Hrvatskom veterinarskom institutu. Glavni cilj projektnog prijedloga je utvrđivanje najkvalitetnijih i najbržih metoda od trenutačno dostupnih za određivanje i tipizaciju L. monocytogenes na razini vrste, soja i serotipa te uvođenje istih u rutinski rad HVI- a. Usporedit ćemo identifikaciju MALDI-TOF uređajem, molekularnu serotipizaciju, MIC, WGS i FT-IR metode (IR Biotyper uređaj). Osamdeset sojeva podrijetlom iz hrane i pogona, istražit ćemo svakom od navedenih metoda te definirati najkvalitetniju i najinformativniju imajući u vidu vremenski i financijski aspekt, presudne faktore u industriji hrane. Na taj način učinit ćemo RH i HVI u ovom području iznimno vidljivima na europskoj i svjetskoj razini s obzirom da se IR spektrometrija tek razvija u području klasifikacije i bioklusteriranja, a WGS podaci za ovo podneblje su nepostojeći u bazama podataka. Dodatni ciljevi bit će utvrđivanje virulencije i antimikrobne rezistencije sojeva koji kruže ovim područjima kao gorućeg svjetskog problema kojem EU posvećuje ogromnu pažnju. Kroz istraživanje uočit će se i moguće regionalne specifičnosti sojeva što bi omogućilo još bržu i selektivniju tipizaciju najvirulentnijih sojeva te prepoznavanje potencijalnih izboja unutar najviše 30 sati od zaprimanja uzorka.