U ustroju svake podružnice, pa tako i Veterinarskog zavoda u Vinkovcima neophodno je postojanje ustrojbene jedinice koju nazivamo Opća jedinica. Njezina je aktivnost vrlo bitna za funkcioniranje Zavoda, jer djelatnici obavljaju poslove od interesa cijelog Zavoda.
U sklopu Opće jedinice djeluje računovodstvo, koje u suradnji sa računovodstvom u HVI-u obavlja računovodstveno-knjigovodstvene poslove, administrativne poslove i u suradnji sa tajnikom HVI-a pravne poslove širokog spektra. Osim toga, obavljaju i sve administrativne poslove od važnosti za samu podružnicu, ali i poslove od važnosti za tehničko funkcioniranje cijele zgrade, svih laboratorija i opreme i poslove održavanja zgrade.
U sastavu Opće jedinice je i prijem uzoraka, kao vrlo bitan segment u radu Opće jedinice i neophodan je u radu cijelog Zavoda, jer se tu evidentira svaki pristigli uzorak i distribuira u laboratorije u kojima će se obrađivati. Za to se koristi program Vet-Lab koji se konstantno nadograđuje i poboljšava.
U Općoj jedinici djeluje i domar koji se brine za održavanje zgrade, sitne popravke, pravilan rad kotlovnice, održavanje okoliša zgrade i druge poslove iz domene tehničkog održavanja zgrade, automobila i opreme.
